RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 Q4G0T1 1027 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ABI1Q8IZP0 508 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 SCLT1Q96NL6 688 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CWH43Q9H720 699 aa22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DEXIO95424 95 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CDC42EP1Q00587 391 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 LZTS1Q9Y250 596 aa22.87■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CYP3A7P24462 503 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 GPC3P51654 580 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PLCB3Q01970 1234 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 UGCGQ16739 394 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 GALNT17Q6IS24 598 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 BLIDQ8IZY5 108 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 LRRC43Q8N309 656 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 NLRP7Q8WX94 980 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 HCSTQ9UBK5 93 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.86■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PER2O15055 1255 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PSMD10O75832 226 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 GLP2RO95838 553 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ERVFC1P60507 584 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 RNF135Q8IUD6 432 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 CASD1Q96PB1 797 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DACT1Q9NYF0 836 aa22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 PPM1AP35813 382 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DNM2P50570 870 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 KRT17Q04695 432 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DUSP6Q16828 381 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 XKR3Q5GH77 459 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 GJA10Q969M2 543 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ZNF558Q96NG5 402 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.84■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 A0A0U1RQF3 1178 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 FSCN2O14926 492 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 TDP2O95551 362 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 EOMESO95936 686 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 MTERF2Q49AM1 385 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 RNF169Q8NCN4 708 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 RNF19AQ9NV58 838 aa22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ELL3-202ENST00000433927 M0R2N6 131 aa22.82■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.82■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 MBOAT7Q96N66 472 aa22.82■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TCF25Q9BQ70 676 aa22.82■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 STK3Q13188 491 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CHST12Q9NRB3 414 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 SPG21Q9NZD8 308 aa22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CDKL5O76039 1030 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 FGFR4P22455 802 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 EDAQ92838 391 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 KCNH6Q9H252 994 aa22.8■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 STBD1O95210 358 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-202ENST00000433927 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms