RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417977.2

TRBV30-201, Transcript of T cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV30, Length 447 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30-201ENST00000417977 FAM228AQ86W67 206 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 METTL13Q8N6R0 699 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PCYT2Q99447 389 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 OSMRQ99650 979 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ZBP1Q9H171 429 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 USP18Q9UMW8 372 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ACACBO00763 2458 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 A0A0U1RQF3 1178 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CYTH3O43739 400 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 TBC1D4O60343 1298 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SEC23AQ15436 765 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MAP7D2Q96T17 732 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 NFASCO94856 1347 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 COL1A2P08123 1366 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 HIP1O00291 1037 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MAGEB2O15479 319 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ARP10275 920 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SKIP12755 728 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SDSP20132 328 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 KIF5BP33176 963 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MAGEA9P43362 315 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 GNAQP50148 359 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 WTAPQ15007 396 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PJA1Q8NG27 643 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 HELQQ8TDG4 1101 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 GPR152Q8TDT2 470 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 IGSF21Q96ID5 467 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PIDD1Q9HB75 910 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ZNF302Q9NR11 478 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RNF19AQ9NV58 838 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 RAB23Q9ULC3 237 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.48□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 NCAM2O15394 837 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 GPR32O75388 356 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ATG7O95352 703 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 VTNP04004 478 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ALDH2P05091 517 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ADH1AP07327 375 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SMARCA1P28370 1054 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CLCN4P51793 760 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 STARD6P59095 220 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 NETO1Q8TDF5 533 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PHKBQ93100 1093 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SCLT1Q96NL6 688 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 AKT3Q9Y243 479 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 CEP250Q9BV73 2442 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.47□□□□□ -0.89
TRBV30-201ENST00000417977 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.46□□□□□ -0.9
TRBV30-201ENST00000417977 GALTP07902 379 aa9.46□□□□□ -0.9
TRBV30-201ENST00000417977 ZNF76P36508 570 aa9.46□□□□□ -0.9
TRBV30-201ENST00000417977 CDC42EP1Q00587 391 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms