RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMD1Q99460 953 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NAGPAQ9UK23 515 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 BCL9O00512 1426 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 AKAP3O75969 853 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PCK1P35558 622 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CUL1Q13616 776 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 COG2Q14746 738 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NPY5RQ15761 445 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SNCBQ16143 134 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 AOC3Q16853 763 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LIN9Q5TKA1 542 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 USP38Q8NB14 1042 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 COA1Q9GZY4 146 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LTN1O94822 1766 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TNS2Q63HR2 1409 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ECEL1O95672 775 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CASP5P51878 434 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP2R2AP63151 447 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP2R5DQ14738 602 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MIIPQ5JXC2 388 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFRSF25Q93038 417 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LXNQ9BS40 222 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C21orf2O43822 256 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GAP43P17677 238 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 HSD17B3P37058 310 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CORO7P57737 925 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 AMPD2Q01433 879 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TRPC3Q13507 836 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PACS2Q86VP3 889 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL29Q96CT2 875 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 JDP2Q8WYK2 163 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC188H7C350 402 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 HIP1RO75146 1068 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PMS2P54278 862 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MTERF2Q49AM1 385 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 THAP2Q9H0W7 228 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CHRNA5P30532 468 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SOX5P35711 763 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MCTP2Q6DN12 878 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1W2PQJ5 194 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 H0Y3Z8 333 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PON1P27169 355 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MFAP3P55082 362 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP11AP98196 1134 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LONRF1Q17RB8 773 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms