RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC25AP30304 524 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GPC3P51654 580 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CABP7Q86V35 215 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF410Q86VK4 478 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM143Q96AN5 459 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS10Q9H324 1103 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 YEATS4O95619 227 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 EYA4O95677 639 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 BRD1O95696 1058 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CD52P31358 61 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TXLNAP40222 546 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PKP1Q13835 747 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TFDP1Q14186 410 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 HYIQ5T013 277 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PADI6Q6TGC4 694 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R16BQ96T49 567 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 OSMRQ99650 979 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PADI3Q9ULW8 664 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WWV3 80 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTLC2O15270 562 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 USO1O60763 962 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 DARSP14868 501 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP11B2P19099 503 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR5P61964 334 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 NUCB2P80303 420 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 DRP2Q13474 957 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ECM1Q16610 540 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR153Q6NV75 609 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNG4Q8TDN1 519 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GUCD1Q96NT3 240 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CDHR5Q9HBB8 845 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MSRAQ9UJ68 235 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa17.1■□□□□ 0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB30Q15771 203 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP4Q96MN2 994 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CSRNP2Q9H175 543 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO9BQ13459 2157 aa17.08■□□□□ 0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WZ62 844 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL2P36404 184 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PHKA2P46019 1235 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 POU5F1BQ06416 359 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 HERC6Q8IVU3 1022 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM40Q8WWA1 233 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KIFAP3Q92845 792 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TIPINQ9BVW5 301 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KCND2Q9NZV8 630 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.08■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 DENND3A2RUS2 1198 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PMD0 336 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP3O14638 875 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN1Q05586 938 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GRB10Q13322 594 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R5AQ15172 486 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTN1Q2MV58 587 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOCDQ8IZQ8 938 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF149Q8NC42 400 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMA5Q96PV4 448 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PLIN2Q99541 437 aa17.07■□□□□ 0.32
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