RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 IKBKBO14920 756 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 ZEB2O60315 1214 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 ADAMTS4O75173 837 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 MYBP10242 640 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 PEX3P56589 373 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 PPFIA1Q13136 1202 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 MFSD10Q14728 455 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 KAT2BQ92831 832 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 COL1A2P08123 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 K7ENM7 598 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 KIF20AO95235 890 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXA4-201ENST00000360046 KPNA6O60684 536 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PSEN2P49810 448 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TPM4P67936 248 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NCAPHQ15003 741 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MTFR1Q15390 333 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 P2RX5Q93086 422 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 IFT74Q96LB3 600 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MED15Q96RN5 788 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 FIZ1Q96SL8 496 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC169A6NNP5 214 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 GRIK4Q16099 956 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 UVSSAQ2YD98 709 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 RNF180Q86T96 592 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 BSNDQ8WZ55 320 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 BICDL2A1A5D9 508 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 C22orf31O95567 290 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CCNE1P24864 410 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SMTNP53814 917 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 RTP1P59025 263 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 LHX8Q68G74 356 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 METTL13Q8N6R0 699 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 RETREG2Q8NC44 543 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 EVPLQ92817 2033 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 RNF208Q9H0X6 261 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SLC16A4O15374 487 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CCL5P13501 91 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KLRC1P26715 233 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NPTX2P47972 431 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NKX3-2P78367 333 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 DRP2Q13474 957 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KCNA10Q16322 511 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA1Q5VX52 437 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 TCP11Q8WWU5 503 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MAGEB2O15479 319 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ARL2P36404 184 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PLCB2Q00722 1185 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 IER5Q5VY09 327 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 SETD4Q9NVD3 440 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 FANCLQ9NW38 375 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 HAS3O00219 553 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ASGR1P07306 291 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 GLRA2P23416 452 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 DNM2P50570 870 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 NCKAP1LP55160 1127 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 PPP2R5AQ15172 486 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.1■■□□□ 1.45
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