RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.61■□□□□ 0.73
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ACTB-201ENST00000331789 GANQ9H2C0 597 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-201ENST00000331789 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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ACTB-201ENST00000331789 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa19.6■□□□□ 0.73
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ACTB-201ENST00000331789 PON1P27169 355 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 COPB2P35606 906 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NPTX2P47972 431 aa19.58■□□□□ 0.72
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ACTB-201ENST00000331789 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa19.57■□□□□ 0.72
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ACTB-201ENST00000331789 SMTNP53814 917 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MYBPC2Q14324 1141 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PCYT2Q99447 389 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 PORCNQ9H237 461 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 MROH8Q9H579 483 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 EFCC1Q9HA90 598 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 SIX2Q9NPC8 291 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 TBX20Q9UMR3 447 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 ARIH2O95376 493 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 GGPS1O95749 300 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 OATP04181 439 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 KIF11P52732 1056 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-201ENST00000331789 NEDD9Q14511 834 aa19.55■□□□□ 0.72
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