RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 POF1BQ8WVV4 589 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MFSD3Q96ES6 412 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 TNIP3Q96KP6 325 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CEP72Q9P209 647 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MTRRQ9UBK8 725 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.91□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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MMP3-201ENST00000299855 FAM221AA4D161 298 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 GNA15P30679 374 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 ARHGAP25P42331 645 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MNAT1P51948 309 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R5DQ14738 602 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MED15Q96RN5 788 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 STK36Q9NRP7 1315 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 BCL9O00512 1426 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SERTM1A2A2V5 107 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 TEX33O43247 280 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 OPA1O60313 960 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 KRT1P04264 644 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CHGBP05060 677 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 P4HA1P13674 534 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 STMN1P16949 149 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CASP7P55210 303 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MPP1Q00013 466 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 ITIH3Q06033 890 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SPAG1Q07617 926 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CCNG2Q16589 344 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 VWA3BQ502W6 1294 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 WASF1Q92558 559 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 MTMR8Q96EF0 704 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 CLIC6Q96NY7 704 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 SH3GL2Q99962 352 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.9□□□□□ -0.82
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MMP3-201ENST00000299855 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.9□□□□□ -0.82
MMP3-201ENST00000299855 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CD4P01730 458 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CASP14P31944 242 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ECE1P42892 770 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MTHFRP42898 656 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GJA9P57773 515 aa9.89□□□□□ -0.83
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MMP3-201ENST00000299855 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PTPN21Q16825 1174 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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MMP3-201ENST00000299855 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GGA2Q9UJY4 613 aa9.89□□□□□ -0.83
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MMP3-201ENST00000299855 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AGPSO00116 658 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ZNF213O14771 459 aa9.89□□□□□ -0.83
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MMP3-201ENST00000299855 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FSBPO95073 299 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GUCA1CO95843 209 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GYPCP04921 128 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MYBL2P10244 700 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GGCXP38435 758 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ANTXR2P58335 489 aa9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CUL4BQ13620 913 aa9.89□□□□□ -0.83
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