RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A1P19634 815 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CASQ1P31415 396 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ACCSQ96QU6 501 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MMP19Q99542 508 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.94■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ACTN1P12814 892 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ATP4AP20648 1035 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TFR2Q9UP52 801 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 WDR81Q562E7 1941 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 COPB2P35606 906 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-9P63128 1117 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD2Q14681 263 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 BSNDQ8WZ55 320 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 GANQ9H2C0 597 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF302Q9NR11 478 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC169A6NNP5 214 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 SOCS7O14512 581 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KIF5CO60282 957 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 NPTX2P47972 431 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 XKR3Q5GH77 459 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 RDH13Q8NBN7 331 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC42Q96M95 316 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.92■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC3O60645 756 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MTERF2Q49AM1 385 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PORCNQ9H237 461 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 DGAT1O75907 488 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PON1P27169 355 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 LY6KQ17RY6 165 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KIFAP3Q92845 792 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MROH8Q9H579 483 aa24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KRT83P78385 493 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 CYP27A1Q02318 531 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EFCC1Q9HA90 598 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF263O14978 683 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TLR2O60603 784 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 SMTNP53814 917 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA3Q9UL41 463 aa24.9■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ARIH2O95376 493 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 GGPS1O95749 300 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 OATP04181 439 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 MYBPC2Q14324 1141 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 NEDD9Q14511 834 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 HGSNATQ68CP4 663 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PCYT2Q99447 389 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 TBX20Q9UMR3 447 aa24.89■■□□□ 1.58
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.89■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 UNCXA6NJT0 531 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 PDHXO00330 501 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM49P0CI25 452 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM49CP0CI26 452 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 TGFB3P10600 412 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GBP6Q6ZN66 633 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 RRAGCQ9HB90 399 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 GCNT4Q9P109 453 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ARID2Q68CP9 1835 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 RCCD1A6NED2 376 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 KIF11P52732 1056 aa24.88■■□□□ 1.57
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms