RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266674.9

LGR5-201, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LGR5, Length 4,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5-201ENST00000266674 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 CSRNP1Q96S65 589 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L15C9J2P7 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L11C9JVI0 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L18D6R9N7 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L22D6RA61 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L19D6RCP7 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L20D6RJB6 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ZBTB5O15062 677 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PPIP5K2O43314 1243 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TDP2O95551 362 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L24Q0WX57 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SPATA21Q7Z572 469 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 A0A0G2JLW4 131 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 JADE1Q6IE81 842 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 BATF3Q9NR55 127 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 GGT7Q9UJ14 662 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 CHN1P15882 459 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.85□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PFASO15067 1338 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 POTEFA5A3E0 1075 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ORC4O43929 436 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 POTEIP0CG38 1075 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 FGFR4P22455 802 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 POTEGQ6S5H5 508 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 CFAP36Q96G28 342 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 DYDC2Q96IM9 177 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SERPINI1Q99574 410 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 NUP85Q9BW27 656 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TFR2Q9UP52 801 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 NBPF26B4DH59 902 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 H3BQF6 201 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 DIAPH2O60879 1101 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 CD58P19256 250 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 STAT2P52630 851 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PTPAQ15257 358 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 NBPF15Q8N660 670 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 AK9Q5TCS8 1911 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 CFLARO15519 480 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 RAD51CO43502 376 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PEX3P56589 373 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PTGISQ16647 500 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 MORC4Q8TE76 937 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SENP2Q9HC62 589 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SUFUQ9UMX1 484 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ALKQ9UM73 1620 aa14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ZNF233A6NK53 670 aa14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 GGPS1O95749 300 aa14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 ARFIP2P53365 341 aa14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
LGR5-201ENST00000266674 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 ERVK-24P63145 666 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 CEP95Q96GE4 821 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 FAM20AQ96MK3 541 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 SOX5P35711 763 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 TMED1Q13445 227 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 HPSEQ9Y251 543 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 USP31Q70CQ4 1352 aa14.83□□□□□ -0.04
LGR5-201ENST00000266674 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms