RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CHUKO15111 745 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CAP2P40123 477 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PSMC6P62333 389 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KCNMA1Q12791 1236 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SNCBQ16143 134 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SPAG5Q96R06 1193 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 VCPKMTQ9H867 229 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NRAPQ86VF7 1730 aa9.56□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NFIBO00712 420 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SKOR1P84550 965 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FUKQ8N0W3 1084 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RETREG2Q8NC44 543 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 DYDC2Q96IM9 177 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NUP58Q9BVL2 599 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 GMNCA6NCL1 334 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SHBGP04278 402 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ZNF844Q08AG5 666 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 GRB10Q13322 594 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NEDD9Q14511 834 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 BAP1Q92560 729 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 A8MUI8 341 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FAM86B1E9PN63 330 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 DCAF15Q66K64 600 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PDXDC1Q6P996 788 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CCDC25Q86WR0 208 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 GLG1Q92896 1179 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 HVCN1Q96D96 273 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ATG4CQ96DT6 458 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.55□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 KRIT1O00522 736 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FSBPO95073 299 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FAM107AO95990 144 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SLC9A1P19634 815 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ADAM9Q13443 819 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RPS6KA1Q15418 735 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 HGSNATQ68CP4 663 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RAD54LQ92698 747 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 BICD1Q96G01 975 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 OTUD5Q96G74 571 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RMDN3Q96TC7 470 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SNED1Q8TER0 1413 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 RSPH10BP0C881 870 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SCTRP47872 440 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 DAAM2Q86T65 1068 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 SFR1Q86XK3 245 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 CSADQ9Y600 493 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 MYH6P13533 1939 aa9.54□□□□□ -0.88
RRN3-201ENST00000198767 PCNTO95613 3336 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms