RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217779.1

Trdn-202, Transcript of Triadin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trdn, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdn-202ENSMUST00000217779 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ankrd63A2ARS0 390 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Nedd9O35177 833 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Nhlh1Q02576 133 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rundc1Q0VDN7 615 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Usp39Q3TIX9 564 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Qsox2Q3TMX7 692 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 PigvQ7TPN3 493 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Il23rQ8K4B4 644 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Emc7Q9EP72 241 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Thsd1Q9JM61 851 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Npas3Q9QZQ0 925 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Apobec2Q9WV35 224 aa8.4□□□□□ -1.06
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ube2ql1A0PJN4 161 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Trim30bE9PVL6 203 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Folh1O35409 752 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 MafgO54790 162 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Fam178bQ24JP3 464 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Hephl1Q3V1H3 1159 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 IbspQ61711 324 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ddx42Q810A7 929 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Slc17a6Q8BLE7 582 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Osbpl6Q8BXR9 959 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Mfsd6lQ8R3N2 586 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Kdm4bQ91VY5 1086 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ifrd2Q9D8U0 441 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Pde7bQ9QXQ1 446 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Itgb1bp2Q9R000 350 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 TinagQ9WUR0 475 aa8.39□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ly9Q01965 654 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Syne3Q4FZC9 975 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 ManeaQ6NXH2 462 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Lypd4Q8BVP6 246 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 NpntQ91V88 561 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Kremen1Q99N43 473 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 AcoxlQ9DBS4 632 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Lmbr1Q9JIT0 490 aa8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Cnga1P29974 684 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Btbd3P58545 530 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 E2f8Q58FA4 860 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Gpr19Q61121 415 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ceacam10Q61400 265 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Sez6lQ6P1D5 963 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Frmd5Q6P5H6 517 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 BC049730Q810N3 246 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Serinc2Q8K0E7 450 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Q922C1 641 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Dlgap1Q9D415 992 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa8.37□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rad52P43352 420 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 PrkcqQ02111 707 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 StimateQ3UF25 288 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Adam1aQ60813 791 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Dsg1cQ7TSF0 911 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Rnf183Q8QZS5 190 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Dkk2Q9QYZ8 259 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Sema4fQ9Z123 777 aa8.36□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Nr4a1P12813 601 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Cap1P40124 474 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Sesn2P58043 480 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Kcna7Q17ST2 489 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Zfp280bQ505F4 534 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 TbataQ7TSD4 393 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Mtfr2Q8VED8 361 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Dcaf11Q91VU6 549 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Lzts2Q91YU6 671 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Jag2Q9QYE5 1247 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Nphs1Q9QZS7 1256 aa8.35□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 AcadmP45952 421 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Krt2Q3TTY5 707 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Usp7Q6A4J8 1103 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 LssQ8BLN5 733 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Spata32Q8C5V0 334 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Ushbp1Q8R370 680 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Q9D454 513 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Cdyl2Q9D5D8 503 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Tas2r105Q9JKT4 300 aa8.34□□□□□ -1.07
Trdn-202ENSMUST00000217779 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa8.33□□□□□ -1.08
Trdn-202ENSMUST00000217779 Pold2O35654 469 aa8.33□□□□□ -1.08
Trdn-202ENSMUST00000217779 Igfbp6P47880 238 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.5 ms