Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Dsg1cQ7TSF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Dsg1cQ7TSF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Dsg1cQ7TSF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Dsg1cQ7TSF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Dsg1cQ7TSF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Dsg1cQ7TSF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Dsg1cQ7TSF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,2■■■□□ 2,27
Dsg1cQ7TSF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Dsg1cQ7TSF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Dsg1cQ7TSF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
Dsg1cQ7TSF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Dsg1cQ7TSF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Dsg1cQ7TSF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Dsg1cQ7TSF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Dsg1cQ7TSF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Dsg1cQ7TSF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Dsg1cQ7TSF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Dsg1cQ7TSF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Dsg1cQ7TSF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Dsg1cQ7TSF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Dsg1cQ7TSF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Dsg1cQ7TSF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Dsg1cQ7TSF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Dsg1cQ7TSF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Dsg1cQ7TSF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Dsg1cQ7TSF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Dsg1cQ7TSF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Dsg1cQ7TSF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Dsg1cQ7TSF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Dsg1cQ7TSF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Dsg1cQ7TSF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Dsg1cQ7TSF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Dsg1cQ7TSF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Dsg1cQ7TSF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Dsg1cQ7TSF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Dsg1cQ7TSF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Dsg1cQ7TSF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Dsg1cQ7TSF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Dsg1cQ7TSF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Dsg1cQ7TSF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Dsg1cQ7TSF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Dsg1cQ7TSF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Dsg1cQ7TSF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Dsg1cQ7TSF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Dsg1cQ7TSF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Dsg1cQ7TSF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Dsg1cQ7TSF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Dsg1cQ7TSF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Dsg1cQ7TSF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Dsg1cQ7TSF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Dsg1cQ7TSF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Dsg1cQ7TSF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Dsg1cQ7TSF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Dsg1cQ7TSF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Dsg1cQ7TSF0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Dsg1cQ7TSF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Dsg1cQ7TSF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Dsg1cQ7TSF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Dsg1cQ7TSF0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Dsg1cQ7TSF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Dsg1cQ7TSF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Dsg1cQ7TSF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Dsg1cQ7TSF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Dsg1cQ7TSF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Dsg1cQ7TSF0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Dsg1cQ7TSF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Dsg1cQ7TSF0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Dsg1cQ7TSF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Dsg1cQ7TSF0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Dsg1cQ7TSF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Dsg1cQ7TSF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Dsg1cQ7TSF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96,8 ms