Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Dsg1cQ7TSF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dsg1cQ7TSF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Dsg1cQ7TSF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Dsg1cQ7TSF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Dsg1cQ7TSF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Dsg1cQ7TSF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dsg1cQ7TSF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Dsg1cQ7TSF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Dsg1cQ7TSF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dsg1cQ7TSF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Dsg1cQ7TSF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dsg1cQ7TSF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dsg1cQ7TSF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dsg1cQ7TSF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dsg1cQ7TSF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dsg1cQ7TSF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dsg1cQ7TSF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dsg1cQ7TSF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Dsg1cQ7TSF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dsg1cQ7TSF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dsg1cQ7TSF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dsg1cQ7TSF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Dsg1cQ7TSF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Dsg1cQ7TSF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dsg1cQ7TSF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dsg1cQ7TSF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dsg1cQ7TSF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dsg1cQ7TSF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dsg1cQ7TSF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dsg1cQ7TSF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dsg1cQ7TSF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dsg1cQ7TSF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dsg1cQ7TSF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dsg1cQ7TSF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg1cQ7TSF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dsg1cQ7TSF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dsg1cQ7TSF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg1cQ7TSF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dsg1cQ7TSF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dsg1cQ7TSF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dsg1cQ7TSF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dsg1cQ7TSF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dsg1cQ7TSF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dsg1cQ7TSF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Dsg1cQ7TSF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg1cQ7TSF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dsg1cQ7TSF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dsg1cQ7TSF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsg1cQ7TSF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsg1cQ7TSF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dsg1cQ7TSF0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dsg1cQ7TSF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dsg1cQ7TSF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dsg1cQ7TSF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dsg1cQ7TSF0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dsg1cQ7TSF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dsg1cQ7TSF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dsg1cQ7TSF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsg1cQ7TSF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg1cQ7TSF0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg1cQ7TSF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg1cQ7TSF0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg1cQ7TSF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg1cQ7TSF0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg1cQ7TSF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1cQ7TSF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg1cQ7TSF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms