RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA PUT4P15380 627 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA EPT1P22140 391 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA MRPS5P33759 307 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA DTR1P38125 572 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA IST2P38250 946 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YER184CP39961 794 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YMR134WP40207 237 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA MOB2P43563 287 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YHC3P47040 408 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA VEL1P53058 206 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RMI1Q02685 241 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA APC5Q08683 685 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA FRE8Q12209 686 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA NFI1Q12216 726 aa2.28□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SWI3P32591 825 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SMP1P38128 452 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RCK2P38623 610 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ATG7P38862 630 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YNL320WP42840 284 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA STB1P42845 420 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YGR067CP53243 804 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA AQR1P53943 586 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SUR7P54003 302 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA MRX11Q03079 207 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RRB1Q04225 511 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA NAT4Q04751 285 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ALE1Q08548 619 aa2.28□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SAG1P20840 650 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA MXR2P25566 168 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
15S_rRNA15S_rRNA PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SIF2P38262 535 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PRM1P53835 661 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA CSM3Q04659 317 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YOR012WQ12351 137 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YOL085CQ99345 113 aa2.27□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA STE3P06783 470 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA TAL1P15019 335 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ERG9P29704 444 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA MKK1P32490 508 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PEX32P38292 413 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA EFM1P38732 585 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA COQ5P49017 307 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SED5Q01590 340 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ARR1Q06596 294 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA DDC1Q08949 612 aa2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA STE2D6VTK4 431 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA URA10P30402 227 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YEL043WP32618 956 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PCH2P38126 564 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA GGC1P38988 300 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RRT13P40042 185 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SPT7P35177 1332 aa2.25□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA UTR1P21373 530 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA HXT2P23585 541 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ZIP1P31111 875 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YKL071WP36086 256 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SCS7Q03529 384 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RGS2Q99188 309 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RAD1P06777 1100 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YLL053CP0CD98 152 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA DCC1P25559 380 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA TIP20P33891 701 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA UIP5P36137 443 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA FHL1P39521 936 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YCH1P42937 148 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA API2Q04413 109 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA MMT2Q08970 484 aa2.24□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA CIN8P27895 1000 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA ALP1P38971 573 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YIL089WP40500 205 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA HST1P53685 503 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA RPN6Q12377 434 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.23□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA CKA2P19454 339 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA MMS21P38632 267 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA FRT2P39734 528 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YFR018CP43599 363 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA YNL146WP53906 100 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA FAR10Q06001 478 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA TAF10Q12030 206 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA PSY3Q12318 242 aa2.22□□□□□ -2.05
15S_rRNA15S_rRNA SMI1P32566 505 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.7 ms