RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W GPI17Q04080 534 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YMR087WQ04299 284 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MGR3Q04472 501 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ARV1Q06541 321 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BSC6Q08280 497 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TPO4Q12256 659 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W APC2Q12440 853 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W GAL4P04386 881 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W DPM1P14020 267 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YCR100CP25606 316 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W NPL6P32832 435 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ORC2P32833 620 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YIL152WP40455 235 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W IRC7P43623 340 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ALK1P43633 760 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BUD17P53727 317 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W INP1Q03694 420 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W FIN1Q03898 291 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W VID22Q05934 901 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YLR040CQ07988 224 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SOG2Q08817 791 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W UIP4Q08926 304 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SPC3Q12133 184 aa8.65□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W AI1P03875 834 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MET2P08465 486 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W GIT1P25346 518 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YCR006CP25350 157 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YKL077WP36081 392 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YHR035WP38769 630 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W UTP25P40498 721 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W ICE2P40499 491 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W APS3P47064 194 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W OST6Q03723 332 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SIZ1Q04195 904 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W URC2Q04411 772 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YPQ2Q06328 317 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W OPT2Q06593 877 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W CDA2Q06703 312 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MED2Q12124 431 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa8.64□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W BAR1P12630 587 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PBN1P25580 416 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W ARO7P32178 256 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W KAP122P32767 1081 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SUR1P33300 382 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W GPX2P38143 162 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPS20P38701 121 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W AIM10P39965 576 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PCL6P40038 420 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YGL101WP53144 215 aa8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W DET1Q99288 334 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPN13O13563 156 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W ERD1P16151 362 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W GPI12P23797 304 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SBA1P28707 216 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W TAF14P35189 244 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W EXO84P38261 753 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RTC2P38279 296 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W CHL4P38907 458 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W IDS2P46958 469 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W TRM9P49957 279 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W LSG1P53145 640 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YGR266WP53326 701 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YLR346CQ06139 101 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YLR456WQ06199 204 aa8.62□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W DCG1P32460 244 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YPT7P32939 208 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MCM7P38132 845 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W IFA38P38286 347 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NVJ1P38881 321 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W VPS52P39904 641 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W COS10P52924 374 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YGL235WP53071 178 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SCW11P53189 542 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W CPR8P53728 308 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MNT4P53745 580 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W CIK1Q01649 594 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RCF1Q03713 159 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SYO1Q07395 620 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W ACF2Q12168 779 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PCL9Q12477 304 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PSF1Q12488 208 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W LSO1Q3E827 93 aa8.61□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SAC7P17121 654 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W STP22P25604 385 aa8.6□□□□□ -1.03
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