RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBC2	YPL178W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ECL1	P48235	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	GPI8	P49018	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YGL260W	P53056	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	COS6	P53344	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	IGO1	P53897	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	NCE101	Q02820	53 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	RRN5	Q02983	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	DCR2	Q05924	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	MDM32	Q12171	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	TSC13	Q99190	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	CDC9	P04819	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	SAC7	P17121	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ERG8	P24521	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YIM1	P28625	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	SPC34	P36131	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	RIB1	P38066	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YJL193W	P39542	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	PZF1	P39933	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	SNM1	P40993	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ILM1	P47155	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	NUP57	P48837	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YGR016W	P53209	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	MTQ1	P53944	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	PFA5	Q03289	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	INP1	Q03694	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	ARO10	Q06408	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	PSY3	Q12318	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	MRX4	Q12467	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBC2	YPL178W	TIM9	O74700	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BAR1	P12630	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ERD1	P16151	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	EMP70	P32802	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
CBC2	YPL178W	ECM34	P38728	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ANS1	P38832	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	NSG1	P38837	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PKP1	P40530	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PHB1	P40961	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ECO1	P43605	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ERP6	P53198	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ATG21	Q02887	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ISU1	Q03020	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HNT3	Q08702	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	VIK1	Q12045	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YCK1	P23291	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YPT7	P32939	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TPO5	P36029	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YKR073C	P36153	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RCY1	P39531	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MPM1	P40364	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BLM10	P43583	2143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FMP33	P46998	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YGR168C	P53293	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SPR6	Q01684	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RSM28	Q03430	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BUR2	Q05949	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SEI1	Q06058	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ARV1	Q06541	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	VPS36	Q06696	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CDA2	Q06703	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RDR1	Q08904	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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