RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	RGS2	Q99188	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DIF1	O13577	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
RRN11	YML043C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DCC1	P25559	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YCL002C	P25565	263 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MCM10	P32354	571 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RGT1	P32862	1170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CSG2	P35206	410 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SOL2	P37262	315 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GPX2	P38143	162 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SRO77	P38163	1010 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FIG1	P38224	298 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FMP23	P38231	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LAG1	P38703	411 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NSG1	P38837	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SER2	P42941	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NSE4	P43124	402 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IRC8	P47046	822 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SOL1	P50278	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRH4	P53166	561 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRPL22	P53881	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SAE3	P89114	91 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TOF2	Q02208	771 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SKY1	Q03656	742 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YET2	Q04210	160 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TVP18	Q04767	167 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PSR2	Q07949	397 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	INP53	Q12271	1107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GAL80	P04387	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRP7	P12687	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	COQ1	P18900	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	DAL2	P25335	343 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPT7	P32939	208 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LOT5	P34234	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SSS1	P35179	80 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TVP38	P36164	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	LAS21	P40367	830 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	OPT1	P40897	799 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SHR5	P41912	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YGR201C	P42936	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	AIM23	P47015	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MOG1	P47123	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ECM27	P47144	725 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NBP35	P52920	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	TIM44	Q01852	431 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YHM2	Q04013	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PEX12	Q04370	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	FSH3	Q99369	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MYO1	P08964	1928 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	NUC1	P08466	329 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CDC6	P09119	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SAM35	P14693	329 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SPO7	P18410	259 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PEX4	P29340	183 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	IMP2'	P32351	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	YKL162C	P36052	402 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RRN10	P38204	145 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	VHC1	P38329	1120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GEP4	P38812	185 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CYC2	P38909	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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