RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	CIN5	P40917	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	PAC11	P40960	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	TAX4	P47030	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	SNX4	P47057	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YDL186W	P48568	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YGL108C	P53139	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YGR042W	P53227	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	MPS1	P54199	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	KRE28	Q04431	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	SPC24	Q04477	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	BUR2	Q05949	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	NKP2	Q06162	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	YFT2	Q06676	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	CYK3	Q07533	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	ESA1	Q08649	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	MSH5	Q12175	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	RGS2	Q99188	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMD8	YML038C	SNA3	P14359	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	KAR4	P25583	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	GAC1	P28006	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YMD8	YML038C	YOX1	P34161	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YPK3	P38070	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	QDR3	P38227	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	TRM5	P38793	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	DSE1	P40077	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AGP3	P43548	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RTT101	P47050	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SOL4	P53315	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SPC98	P53540	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	VPS60	Q03390	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ARR3	Q06598	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	PER33	Q12144	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RUP1	Q12242	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	LAS17	Q12446	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	COX3	P00420	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	MAS2	P11914	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RPC34	P32910	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	TRM2	P33753	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ELO1	P39540	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YJR149W	P47177	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SCS3	P53012	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AIM33	Q04516	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	COQ9	Q05779	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ENB1	Q08299	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AFT2	Q08957	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AAC1	P04710	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RIP1	P08067	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	POX1	P13711	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RRN10	P38204	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	BMT2	P38278	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SDH8	P38345	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	HIS2	P38635	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	FMO1	P38866	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SRP14	P38985	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	CIN4	P39110	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	CSM2	P40465	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	POG1	P40473	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	RSM25	P40496	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	PHB1	P40961	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ATG27	P46989	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YGR168C	P53293	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	MTQ1	P53944	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	GIS1	Q03833	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	AAD15	Q08361	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	SIA1	Q12212	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMD8	YML038C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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