RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	BYE1	P36106	594 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FRM2	P37261	193 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ECM34	P38728	170 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RRT13	P40042	185 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ATM1	P40416	690 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PIB2	P53191	635 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ZRG17	P53735	605 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RMI1	Q02685	241 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ECM7	Q06200	448 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ASA1	Q06822	443 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DDC1	Q08949	612 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ATP16	Q12165	160 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AUS1	Q08409	1394 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SAL1	D6W196	494 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	EPT1	P22140	391 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CLB1	P24868	471 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.43	□□□□□ -2.34	not detected
NNF2	YGR089W	AST1	P35183	429 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YBR241C	P38142	488 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SHE1	P38200	338 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	QDR3	P38227	689 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FAD1	P38913	306 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YIR035C	P40579	254 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BIO3	P50277	480 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YGR015C	P53208	328 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	URC2	Q04411	772 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NSE1	Q07913	336 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AEP3	Q12089	606 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HIF1	Q12373	385 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CPR2	P23285	205 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YSC83	P32792	385 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SRB2	P34162	210 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DOA1	P36037	715 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TRR2	P38816	342 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STB1	P42845	420 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CDH1	P53197	566 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RNH201	P53942	307 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MDM1	Q01846	1127 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MRX11	Q03079	207 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FSH2	Q05015	223 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GAT3	Q07928	141 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	UAF30	Q08747	228 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	LDB17	Q12342	491 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HMS1	Q12398	434 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	HEM4	P06174	275 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPC53	P25441	422 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PHO91	P27514	894 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ZIP1	P31111	875 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	LDS1	P31379	325 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPN12	P32496	274 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ZIM17	P42844	174 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	COS4	P43542	379 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YJL144W	P47009	104 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YJR054W	P47114	497 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ROG1	P53118	685 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	INP2	Q03824	705 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MRX8	Q05473	314 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	LDS2	Q08218	356 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	INH1	P01097	85 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PDX1	P16451	410 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PMT2	P31382	759 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DBF4	P32325	704 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
NNF2	YGR089W	PAC11	P40960	533 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SED5	Q01590	340 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FAR10	Q06001	478 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDL109C	Q12103	647 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	FLO11	P08640	1367 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MMS22	Q06164	1454 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	COS9	P36034	407 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SDH4	P37298	181 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YIL059C	P40520	121 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SRB7	P47822	140 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YGR111W	P53265	400 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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