RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C MTQ1P53944 314 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RHO4Q00246 291 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SED5Q01590 340 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YPL014WQ02606 381 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C IVY1Q04934 453 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C VPS74Q06385 345 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YOR389WQ08912 624 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RKM5Q12367 367 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YKL183C-AQ3E765 70 aa6□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ATP6P00854 259 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YBR121C-AP0C5L4 52 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ARF2P19146 181 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C FAR1P21268 830 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SAT4P25333 603 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SPS19P32573 292 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C IES6P32617 166 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C UTR4P32626 227 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ATG7P38862 630 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C FHL1P39521 936 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YNL194CP40169 301 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RNT1Q02555 471 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RIM13Q03792 727 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C TMN2Q04562 672 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SNF8Q12483 233 aa5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHO1YER118C TRP3P00937 484 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SNF6P18888 332 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C MRPL8P22353 238 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C CMK2P22517 447 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C NUP2P32499 720 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C COX13P32799 129 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C AST1P35183 429 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C TAF14P35189 244 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C RSM22P36056 628 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C IST2P38250 946 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C CCT4P39078 528 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C THO1P40040 218 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C AZR1P50080 613 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C PHB2P50085 310 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C LSG1P53145 640 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C GPI1P53306 609 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SOL4P53315 255 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C NOP19P53317 196 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C HER2Q03557 464 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C CAC2Q04199 468 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C FAR8Q05040 523 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C MCH4Q08268 501 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C MCA1Q08601 432 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C APC9Q12107 265 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ORT1Q12375 292 aa5.98□□□□□ -1.45
SHO1YER118C HIS1P00498 297 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C HTB1P02293 131 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C HTB2P02294 131 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C POX1P13711 748 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YMR31P19955 123 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C BUB3P26449 341 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C PDR3P33200 976 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C VPS21P36017 210 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YBR056WP38081 501 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C URA8P38627 578 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C FAA2P39518 744 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C PHO90P39535 881 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C HOC1P47124 396 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C GET1P53192 235 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ZRG17P53735 605 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C ATG17Q06410 417 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C YOR387CQ08910 206 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C GRE1Q08969 168 aa5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SHO1YER118C MAK32P23060 363 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C PTP1P25044 335 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RPS2P25443 254 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RIM2P38127 377 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data5.96□□□□□ -1.46 RIP-Chip
SHO1YER118C BDH2P39713 417 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C EXO1P39875 702 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C DDI1P40087 428 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YIR016WP40572 265 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RTT101P47050 842 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RRN9P53437 365 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YPL080CQ02826 108 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C PRM15Q03262 622 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C GPM2Q12008 311 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SET6Q12529 373 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YCL012CQ8J0M4 134 aa5.96□□□□□ -1.46
SHO1YER118C QCR7P00128 127 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C FBA1P14540 359 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SPO12P17123 173 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RBK1P25332 333 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C DCC1P25559 380 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SNC1P31109 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C FLO10P36170 1169 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C DTR1P38125 572 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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