RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W YNR068CP53754 272 aa2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W ECM11Q04110 302 aa2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W GLE1Q12315 538 aa2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W HIF1Q12373 385 aa2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W FSH3Q99369 266 aa2.56□□□□□ -2
NSE4YDL105W ASP3-2P0CX77 362 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W ASP3-3P0CX78 362 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W ASP3-4P0CX79 362 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W ASP3-1P0CZ17 362 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W THR4P16120 514 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W SWI3P32591 825 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W VAM7P32912 316 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W YKR015CP36111 568 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W SEO1P39709 593 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W KEG1P43614 200 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W GAS2Q06135 555 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W YLR177WQ06251 628 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W YOL075CQ08234 1294 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W MCT1Q12283 360 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W LDB17Q12342 491 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W NBL1Q3E7Y6 73 aa2.55□□□□□ -2
NSE4YDL105W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W MAS1P10507 462 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W RDS1P25611 832 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W HMX1P32339 317 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W DPH2P32461 534 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W APE4P38821 490 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W YJR030CP47101 745 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W RNH201P53942 307 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W VAC7P53950 1165 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W AIM33Q04516 312 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W YDR115WQ04598 105 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W YPR078CQ06813 372 aa2.54□□□□□ -2
NSE4YDL105W ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W ANP1P32629 500 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W YBR241CP38142 488 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W RBG1P39729 369 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W ATP16Q12165 160 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W NFI1Q12216 726 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W UBA3Q99344 299 aa2.53□□□□□ -2
NSE4YDL105W UNG1P12887 359 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W TOA1P32773 286 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W ECT1P33412 323 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YFL012WP43580 148 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W PGU1P47180 361 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YGR018CP53211 109 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W LST7P53237 242 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YNL143CP53908 130 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W AQR1P53943 586 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SLT2Q00772 484 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SMP3Q04174 516 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.52□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SPT7P35177 1332 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W GRR1P24814 1151 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W HEM14P40012 539 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W AIM23P47015 356 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W VEL1P53058 206 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W FLC3P53121 802 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W PRM1P53835 661 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W ARR1Q06596 294 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W APC5Q08683 685 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SRO7Q12038 1033 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W SFG1Q12507 346 aa2.51□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W CKI1P20485 582 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W FAR1P21268 830 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YNL320WP42840 284 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YHC3P47040 408 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W BIO3P50277 480 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W CDH1P53197 566 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W YOR012WQ12351 137 aa2.5□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W STE3P06783 470 aa2.49□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W TAL1P15019 335 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W EPT1P22140 391 aa2.49□□□□□ -2.01
NSE4YDL105W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
NSE4YDL105W SIF2P38262 535 aa2.49□□□□□ -2.01
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