RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DSE	Q9UL01	958 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	AFF2	P51816	1311 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ECE2	O60344	883 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PTPN4	P29074	926 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STX2	P32856	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LSP1	P33241	339 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PSMC4	P43686	418 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	IGBP1	P78318	339 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MECOM	Q03112	1051 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EPS8	Q12929	822 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	E2F4	Q16254	413 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLC3	Q6P597	504 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	BORA	Q6PGQ7	559 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FUK	Q8N0W3	1084 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLHL29	Q96CT2	875 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MUC13	Q9H3R2	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RGL1	Q9NZL6	768 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM83G	A6ND36	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	USP27X	A6NNY8	438 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HOXC6	P09630	235 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CENPP	Q6IPU0	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NOD2	Q9HC29	1040 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EHD2	Q9NZN4	543 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PLAA	Q9Y263	795 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	JAK2	O60674	1132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GJB6	O95452	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP6V1G2	O95670	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ANTXR2	P58335	489 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DR1	Q01658	176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	COPS6	Q7L5N1	327 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TMC2	Q8TDI7	906 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LRRC39	Q96DD0	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	AP5Z1	O43299	807 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLHL2	O95198	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PROZ	P22891	400 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HADHA	P40939	763 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TAF11	Q15544	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FSCB	Q5H9T9	825 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HHAT	Q5VTY9	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	IFT81	Q8WYA0	676 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HAUS1	Q96CS2	278 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CATSPER2	Q96P56	530 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LY9	Q9HBG7	655 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350		H3BNX3	289 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PSTPIP1	O43586	416 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	BUB1	O43683	1085 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HAUS5	O94927	633 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	APOA4	P06727	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ALOX5	P09917	674 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MARK3	P27448	753 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LIG3	P49916	1009 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRADD	Q15628	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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