RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-208ENST00000589104 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RPTORQ8N122 1335 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MMP13P45452 471 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PEX5P50542 639 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GJA10Q969M2 543 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PLAAQ9Y263 795 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 IRF6O14896 467 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 BBOX1O75936 387 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ACTN1P12814 892 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DRD4P21917 467 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PDE6BP35913 854 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GUCY2DQ02846 1103 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 XRCC4Q13426 336 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SGSM3Q96HU1 749 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 EURLQ9NYK6 297 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 COG5Q9UP83 839 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 USP17L10C9JJH3 530 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MAPK13O15264 365 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KRT12Q99456 494 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ESYT3A0FGR9 886 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PSMD10O75832 226 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ALADP13716 330 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MAPK7Q13164 816 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ASIC2Q16515 512 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 QPCTQ16769 361 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SP8Q8IXZ3 490 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FAM20AQ96MK3 541 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NR2E1Q9Y466 385 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 21.4
KDM4B-208ENST00000589104 PAFAH1B1P43034 410 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GUCY1A3Q02108 690 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CAGE1Q8TC20 777 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SLC5A5Q92911 643 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CARD9Q9H257 536 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ENPEPQ07075 957 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ANO3Q9BYT9 981 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 WDR90Q96KV7 1748 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 EYA4O95677 639 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ADAM9Q13443 819 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SLF2Q8IX21 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 JAG2Q9Y219 1238 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 EBAG9O00559 213 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PPIP5K2O43314 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NEBLO76041 1014 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ITGA4P13612 1032 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SOGA3Q5TF21 947 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MFSD5Q6N075 450 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 P3H4Q92791 437 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 COA1Q9GZY4 146 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KCND2Q9NZV8 630 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DNM1LO00429 736 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ERLIN2O94905 339 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RFX1P22670 979 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 STK33Q9BYT3 514 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms