RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SLITRK3	O94933	977 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	IGHA2	P01877	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CNGA1	P29973	690 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SORBS3	O60504	671 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CASP5	P51878	434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NR3C2	P08235	984 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CYBA	P13498	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RIT2	Q99578	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RGS20	O76081	388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KIF20A	O95235	890 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MUT	P22033	750 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EDNRB	P24530	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EPHA7	Q15375	998 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	WDR24	Q96S15	920 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CHP1	Q99653	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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