RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CMTM4-204ENST00000563952 SPIRE1Q08AE8 756 aa34.49■■■■□ 3.11
CMTM4-204ENST00000563952 PLA2G4FQ68DD2 849 aa34.49■■■■□ 3.11
CMTM4-204ENST00000563952 LINC01599Q8WXQ3 324 aa34.49■■■■□ 3.11
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CMTM4-204ENST00000563952 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
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CMTM4-204ENST00000563952 RGL1Q9NZL6 768 aa34.48■■■■□ 3.11
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CMTM4-204ENST00000563952 MTMR9Q96QG7 549 aa34.45■■■■□ 3.11
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF174Q15697 407 aa34.44■■■■□ 3.1
CMTM4-204ENST00000563952 FAM228AQ86W67 206 aa34.44■■■■□ 3.1
CMTM4-204ENST00000563952 CYP26B1Q9NR63 512 aa34.44■■■■□ 3.1
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CMTM4-204ENST00000563952 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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CMTM4-204ENST00000563952 XKR9Q5GH70 373 aa34.38■■■■□ 3.09
CMTM4-204ENST00000563952 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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