RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 SPG21Q9NZD8 308 aa14.74□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CHD6Q8TD26 2715 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 EOMESO95936 686 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 ACTR2P61160 394 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KANK3Q6NY19 840 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 FAM228AQ86W67 206 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 HOXA2O43364 376 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 ATG7O95352 703 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 SLC26A2P50443 739 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 LRRC43Q8N309 656 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 LNPKQ9C0E8 428 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 NFASCO94856 1347 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 ERICH2A1L162 156 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 HIP1O00291 1037 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 HBP1O60381 514 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KRT37O76014 449 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 SMARCA1P28370 1054 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 TRDNQ13061 729 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 TDGQ13569 410 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 WTAPQ15007 396 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 KIZQ2M2Z5 673 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 MAP3K14Q99558 947 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 OSMRQ99650 979 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 IL25Q9H293 177 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.71□□□□□ -0.05
PUF60-211ENST00000527744 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CXCL14O95715 111 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 EPCAMP16422 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 UBE2SQ16763 222 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SIX5Q8N196 739 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 COL1A2P08123 1366 aa14.7□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 GPR32O75388 356 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ABI1Q8IZP0 508 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SDF4Q9BRK5 362 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 KCNK12Q9HB15 430 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 IRAK3Q9Y616 596 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 R4GN57 208 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.69□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 WDR81Q562E7 1941 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 GPR149Q86SP6 731 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ZBP1Q9H171 429 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.68□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 C22orf31O95567 290 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CCNE2O96020 404 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 VTNP04004 478 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 CYP21A2P08686 494 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 ATP4AP20648 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
PUF60-211ENST00000527744 KIF5BP33176 963 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms