RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 SPTLC1O15269 473 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 WIPF1O43516 503 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 GDF9O60383 454 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 FGRP09769 529 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 CALML3P27482 149 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A2P36021 539 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 ITIH3Q06033 890 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 MGAT3Q09327 533 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 CAMK2BQ13554 666 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 LPIN1Q14693 890 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 DNERQ8NFT8 737 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 NETO1Q8TDF5 533 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 PRR14Q9BWN1 585 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 KCNK12Q9HB15 430 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 USP18Q9UMW8 372 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 WASF3Q9UPY6 502 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-204ENST00000495399 COL4A3Q01955 1670 aa8.65□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 NEDD4P46934 1319 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LRRN2O75325 713 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 FGF18O76093 207 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CYP21A2P08686 494 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 MTHFRP42898 656 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 APOBRQ0VD83 1088 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 NECTIN1Q15223 517 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC96Q2M329 555 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 C8orf34Q49A92 452 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SPECC1Q5M775 1068 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PPTC7Q8NI37 304 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LAMA5O15230 3695 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 TSPY2A6NKD2 308 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF213O14771 459 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 ORC4O43929 436 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PPFIA4O75335 1185 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CFHP08603 1231 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 GHRP10912 638 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CES5AQ6NT32 575 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CASC1Q6TDU7 716 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 CASP10Q92851 521 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 COL20A1Q9P218 1284 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 MYH6P13533 1939 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SLC27A2O14975 620 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SPEM2Q0P670 501 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 LAMC2Q13753 1193 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-204ENST00000495399 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms