RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CDIP1Q9H305 208 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PXDNQ92626 1479 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3C2AO00443 1686 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA1LP34931 641 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MTHFSP49914 203 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 GPR85P60893 370 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 RALBP1Q15311 655 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SPATS1Q496A3 300 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 STYK1Q6J9G0 422 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SPATC1Q76KD6 591 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 DPH6Q7L8W6 267 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 FAM124AQ86V42 546 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM209Q96SK2 561 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KCNJ15Q99712 375 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CROTQ9UKG9 612 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PHLPP1O60346 1717 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 K7ESM1 405 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LRG1P02750 347 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 GRIN1Q05586 938 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PRR31Q5SQ13 230 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 BORAQ6PGQ7 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 WRNIP1Q96S55 665 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CDC6Q99741 560 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ALG1Q9BT22 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SBNO1A3KN83 1393 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NSD2O96028 1365 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MROH6A6NGR9 719 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CYP7B1O75881 506 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 GCP02774 474 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SOD2P04179 222 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 COL6A2P12110 1019 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 RASGRF1Q13972 1273 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF4Q96M43 638 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 POLKQ9UBT6 870 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ALS2Q96Q42 1657 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF28P17035 718 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 AMPHP49418 695 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 VASNQ6EMK4 673 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LGI4Q8N135 537 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf37Q96NL8 207 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF10O15013 1369 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LTFP02788 710 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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