RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	MTMR9	Q96QG7	549 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	MAP7D2	Q96T17	732 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	OSMR	Q99650	979 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF3A	Q9Y496	699 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	ENPP3	O14638	875 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	GJB2	P29033	226 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP4A11	Q02928	519 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF174	Q15697	407 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP89	Q96ST8	783 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	LXN	Q9BS40	222 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR32	O75388	356 aa		32.84	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		32.84	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	RFXAP	O00287	272 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	RPS6KA5	O75582	802 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	NPEPPS	P55786	919 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	DRP2	Q13474	957 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRE1	Q14246	886 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	TTC38	Q5R3I4	469 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	INSL6	Q9Y581	213 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXO18-208	ENST00000470089	EPOP	A6NHQ4	379 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	NBR1	Q14596	966 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	YME1L1	Q96TA2	773 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TMX1	Q9H3N1	280 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TTC3	P53804	2025 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ARID2	Q68CP9	1835 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	LINC01553	A4QN01	128 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	IGFBP4	P22692	258 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TPH2	Q8IWU9	490 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	C4orf19	Q8IY42	314 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	POTEM	A6NI47	508 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM228A	Q86W67	206 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP170P1	Q96L14	293 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB39	O15060	712 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	SLITRK3	O94933	977 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	SCLT1	Q96NL6	688 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	OR52Z1	P0C646	297 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAPPC10	P48553	1259 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	GPC3	P51654	580 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	MGEA5	O60502	916 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FBXO18-208	ENST00000470089		H3BQV1	296 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR182	O15218	404 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	TEC	P42680	631 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	DNM2	P50570	870 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	XKR9	Q5GH70	373 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	ODR4	Q5SWX8	454 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	NLRP7	Q8WX94	980 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	PPM1E	Q8WY54	764 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	NEK9	Q8TD19	979 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	TRANK1	O15050	2925 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	ERVK-21	P61565	698 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM2	Q99965	735 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		32.74	■■■□□ 2.83

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