RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC14CA4D256 554 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR23AA6NEV1 266 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTAGE5O15320 804 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIN2DO15399 1336 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRNO43815 780 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 B4GALT4O60513 344 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIP1RO75146 1068 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM200BP0CF97 657 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLT1P17948 1338 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC27P30260 824 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLS1Q14651 629 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHPFQ8IZ52 775 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATL2Q8NHH9 583 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEK9Q8TD19 979 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC3BQ9H195 1237 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHST12Q9NRB3 414 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PALD1Q9ULE6 856 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCTP09848 1927 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM221A6NGB7 291 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H0Y858 1186 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R296 226 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EYA2O00167 538 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALDH1L1O75891 902 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP17L7P0C7H9 530 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CES1P23141 567 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BEX3Q00994 111 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATG4CQ96DT6 458 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC9A7Q96T83 725 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCO2Q9BYV7 579 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIL1Q9H173 461 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR9Q9NR96 1032 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FANCLQ9NW38 375 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASTN1O14525 1302 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM157BP0CG42 384 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GUCY1A2P33402 732 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMC6P62333 389 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRM2Q14416 872 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLUL1Q15846 466 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF394Q53GI3 561 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC89Q8N998 374 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP19Q99542 508 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MROH8Q9H579 483 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms