RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 FANCBQ8NB91 859 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 SEPT8Q92599 483 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 CDHR1Q96JP9 859 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 INSL6Q9Y581 213 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 NRCAMQ92823 1304 aa7.98□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 PRMT3O60678 531 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 ICMTO60725 284 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 GCGRP47871 477 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGAP4P98171 946 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MGAT3Q09327 533 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MTMR1Q13613 665 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 HLA-CQ95604 372 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 TOP1MTQ969P6 601 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 JADE2Q9NQC1 790 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.97□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 NCOR1O75376 2440 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MAFGO15525 162 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 CHRNA1P02708 482 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MARK3P27448 753 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 DPYDQ12882 1025 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 PPFIA1Q13136 1202 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 APBB2Q92870 758 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 PCYT2Q99447 389 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.96□□□□□ -1.13
CTXN3-201ENST00000379445 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.96□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 LINC00271P0C7V0 271 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 GHRP10912 638 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 COL19A1Q14993 1142 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 TCEAL1Q15170 157 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 GRIK4Q16099 956 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RNF20Q5VTR2 975 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 SAMD11Q96NU1 681 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 NEK1Q96PY6 1258 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 YME1L1Q96TA2 773 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 NFASCO94856 1347 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 STXBP3O00186 592 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB43O43298 467 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 NEFLP07196 543 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 LPIN1Q14693 890 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RTN1Q16799 776 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 EPC2Q52LR7 807 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RNF34Q969K3 372 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 PGBD1Q96JS3 809 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.95□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 SIP14410 1827 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 H3BNC9 293 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 UPP2O95045 317 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 ARP10275 920 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 INSRRP14616 1297 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 CDC27P30260 824 aa7.94□□□□□ -1.14
CTXN3-201ENST00000379445 SREBF1P36956 1147 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms