RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 SH3GL2Q99962 352 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 COL6A3P12111 3177 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GVL5 298 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 USP17L10C9JJH3 530 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CXCL11O14625 94 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ALDH1A1P00352 501 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MYBL1P10243 752 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RASA1P20936 1047 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CHMP4BP1P59074 171 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TRIM32Q13049 653 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZUG5 572 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ERICH1Q86X53 443 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SNX27Q96L92 541 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PORCNQ9H237 461 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SYNCQ9H7C4 482 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 KDM1AO60341 852 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PFDN1O60925 122 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 OSBPP22059 807 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MLH1P40692 756 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MTFR1Q15390 333 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 N4BP3O15049 544 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 MAP3K13O43283 966 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CLTAP09496 248 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 IL4RP24394 825 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SNAP25P60880 206 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CAMK2BQ13554 666 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RSPH3Q86UC2 560 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ZNF653Q96CK0 615 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 IFNKQ9P0W0 207 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 HESX1Q9UBX0 185 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CNMDO75829 334 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TGFB3P10600 412 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PDCP20941 246 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 VSNL1P62760 191 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RIPK1Q13546 671 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 DEPTORQ8TB45 409 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 BTBD7Q9P203 1132 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 OPLAHO14841 1288 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 FGAP02671 866 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 FOSL1P15407 271 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 GSTM4Q03013 218 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PPARAQ07869 468 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF6Q15052 776 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-202ENST00000349984 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms