RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 GJB7Q6PEY0 223 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 EFCC1Q9HA90 598 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 MYH4Q9Y623 1939 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 CPP00450 1065 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC15A2Q16348 729 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NFIL3Q16649 462 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPROQ16827 1216 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 ECHS1P30084 290 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 LSP1P33241 339 aa23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PACS2Q86VP3 889 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 HSD17B3P37058 310 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 AMFRQ9UKV5 643 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYZAPP0CAP1 466 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTDSS1-201ENST00000337004 GUCY1A3Q02108 690 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 TPH2Q8IWU9 490 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 PARVGQ9HBI0 331 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 SAMM50Q9Y512 469 aa23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1-201ENST00000337004 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 FMO5P49326 533 aa23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 ERLIN2O94905 339 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 MTMR3Q13615 1198 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 DYDC2Q96IM9 177 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 AMACRQ9UHK6 382 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM253P0C7T8 217 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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PTDSS1-201ENST00000337004 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 ITGA4P13612 1032 aa23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 RFFLQ8WZ73 363 aa23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 CENPHQ9H3R5 247 aa23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1-201ENST00000337004 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.36■■□□□ 1.33
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