RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327158.4

TIMM22-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM22, Length 3,194 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM22-201ENST00000327158 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 GDF3Q9NR23 364 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ATRNL1Q5VV63 1379 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SCN9AQ15858 1988 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KIF4AO95239 1232 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 USP38Q8NB14 1042 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SIX2Q9NPC8 291 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SLX4Q8IY92 1834 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TMCO5BA8MYB1 307 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CEP104O60308 925 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 H2AFZP0C0S5 128 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 NNTQ13423 1086 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 H2AFVQ71UI9 128 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SHTN1A0MZ66 631 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PSMD10O75832 226 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 GFPT2O94808 682 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CHRNA5P30532 468 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 GUCY2FP51841 1108 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KSR1Q8IVT5 923 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 GOPCQ9HD26 462 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 LCMT1Q9UIC8 334 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FAM153BP0C7A2 387 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KCNA3P22001 575 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PRELPP51888 382 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FAM153CQ494X1 144 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CFAP58Q5T655 872 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SRLQ86TD4 932 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FAM178BQ8IXR5 827 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SH3GL2Q99962 352 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SBF1O95248 1867 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CLRN2A0PK11 232 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 RAD51CO43502 376 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FERP16591 822 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ANXA13P27216 316 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 STAT1P42224 750 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 JAM2P57087 298 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PPP2R5CQ13362 524 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CEP55Q53EZ4 464 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PEX26Q7Z412 305 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 LMBR1Q8WVP7 490 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PBKQ96KB5 322 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ZIM3Q96PE6 472 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 MYO1CO00159 1063 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PPFIA4O75335 1185 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CYP2J2P51589 502 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 COG2Q14746 738 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 LRRC57Q8N9N7 239 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TPCN2Q8NHX9 752 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SLC5A5Q92911 643 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ARL8AQ96BM9 186 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 NACC1Q96RE7 527 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 EHMT1Q9H9B1 1298 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TMX2Q9Y320 296 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.311e-19■■■■■ 34.4
TIMM22-201ENST00000327158 CES2O00748 559 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PPIP5K2O43314 1243 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ODR4Q5SWX8 454 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 BORCS6Q96GS4 357 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 PSMD1Q99460 953 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 EVI5O60447 810 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KRT14P02533 472 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 FMO5P49326 533 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 TRADDQ15628 312 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 DAAM2Q86T65 1068 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM22-201ENST00000327158 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms