RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGL1Q9NZL6 768 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPOPA6NHQ4 379 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXKP42681 527 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRP2Q13474 957 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYDC2Q96IM9 177 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMX1Q9H3N1 280 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKT3Q9Y243 479 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF3AQ9Y496 699 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 EYSQ5T1H1 3165 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01553A4QN01 128 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP3O14638 875 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS6KA5O75582 802 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 UPP2O95045 317 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMOD1P28289 359 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJB2P29033 226 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4A11Q02928 519 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC38Q5R3I4 469 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf19Q8IY42 314 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 INSL6Q9Y581 213 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRANK1O15050 2925 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 POTEMA6NI47 508 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAPPC10P48553 1259 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPEPPSP55786 919 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF174Q15697 407 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM228AQ86W67 206 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLITRK3O94933 977 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC3P51654 580 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBR1Q14596 966 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 YME1L1Q96TA2 773 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFXAPO00287 272 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGEA5O60502 916 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52Z1P0C646 297 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK9Q8TD19 979 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPME1Q9Y570 386 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB39O15060 712 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPLA2O95372 231 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-21P61565 698 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPH2Q8IWU9 490 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP170P1Q96L14 293 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR182O15218 404 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUL4AQ13619 759 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODR4Q5SWX8 454 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPXNO60711 386 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFBP4P22692 258 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFC5P40937 340 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNM2P50570 870 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKR9Q5GH70 373 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms