RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314742.12

LINS1-201, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LINS1, Length 4,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-201ENST00000314742 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 KLHL33A6NCF5 533 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CFAP99D6REC4 459 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 OPLAHO14841 1288 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TNFRSF21O75509 655 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TBX18O95935 607 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TMEM11P17152 192 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RCN1Q15293 331 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 OCLNQ16625 522 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CALML4Q96GE6 196 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 PDHBP11177 359 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 NLRP12P59046 1061 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 HAND2P61296 217 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GNAI1P63096 354 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 KCNB1Q14721 858 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ZBTB33Q86T24 672 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 PANK2Q9BZ23 570 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 DPH5Q9H2P9 285 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ACAD9Q9H845 621 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 STAP2Q9UGK3 403 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 NEDD4P46934 1319 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 PDE4BQ07343 736 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SPARCL1Q14515 664 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TNIP1Q15025 636 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 LETM2Q2VYF4 491 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 WDR44Q5JSH3 913 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.95□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TXNL1O43396 289 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GDI1P31150 447 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SCNN1BP51168 640 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 MNAT1P51948 309 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 LIMK1P53667 647 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 NRLP54845 237 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GABREP78334 506 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TRAF1Q13077 416 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 MTX1Q13505 466 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 RUFY3Q7L099 469 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 WHAMMQ8TF30 809 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 SERTM1A2A2V5 107 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 MTSS1O43312 755 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GJB6O95452 261 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 P4HA1P13674 534 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CCNFP41002 786 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 COASYQ13057 564 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 GNPTABQ3T906 1256 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 HECTD3Q5T447 861 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.94□□□□□ -1.62
LINS1-201ENST00000314742 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms