RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000057513.7

TNIP3-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP3, Length 2,416 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3-201ENST00000057513 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 AP1G2O75843 785 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ADAMTS2O95450 1211 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ADAM9Q13443 819 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 SEPT2Q15019 361 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 SBK1Q52WX2 424 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 NENFQ9UMX5 172 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 KLRF2D3W0D1 207 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 SUN1O94901 812 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 GNA11P29992 359 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 CCNG1P51959 295 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ATP11AP98196 1134 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 TAF11Q15544 211 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 KRT79Q5XKE5 535 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ASRGL1Q7L266 308 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 JAMLQ86YT9 394 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 MGARPQ8TDB4 240 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ETAA1Q9NY74 926 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 ZFATQ9P243 1243 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.84□□□□□ -0.03
TNIP3-201ENST00000057513 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FITM2Q8N6M3 262 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 IFT74Q96LB3 600 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 STX8Q9UNK0 236 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TDP2O95551 362 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FGFR4P22455 802 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PRKCIP41743 596 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.83□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RASGRF2O14827 1237 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PON1P27169 355 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 GALCP54803 685 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 NPEPPSP55786 919 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RWDD2BP57060 319 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 SOGA3Q5TF21 947 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 COL4A1P02462 1669 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FAM170AA1A519 330 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FAM187AA6NFU0 413 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 ATP4AP20648 1035 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 MAPK7Q13164 816 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PDIA5Q14554 519 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PLS1Q14651 629 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 BARGINQ6ZT62 677 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RAB34Q9BZG1 259 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.82□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 GJB6O95452 261 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FESP07332 822 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 VPS36Q86VN1 386 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.81□□□□□ -0.04
TNIP3-201ENST00000057513 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms