RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SNM1P40993 198 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W VPS73P53142 486 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CCE1Q03702 353 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CST9Q06032 482 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PLB3Q08108 686 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YCK1P23291 538 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TRX3P25372 127 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RSC6P25632 483 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ATP11P32453 318 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SSO1P32867 290 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SDS22P36047 338 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YKL151CP36059 337 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ECM31P38122 312 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CCZ1P38273 704 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W DBP8P38719 431 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GEP4P38812 185 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TAT2P38967 592 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W FET3P38993 636 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W QDR1P40475 563 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SPO74P45819 413 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ATF2P53296 535 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MNT4P53745 580 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PIR1Q03178 341 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SWF1Q04629 336 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W AEP3Q12089 606 aa9.72□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MCM1P11746 286 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ACB1P31787 87 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data9.71□□□□□ -0.86not detected
PRP4YPR178W TIM17P39515 158 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YER184CP39961 794 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W AAT1Q01802 451 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YMR206WQ03695 313 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W NDD1Q08887 554 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PCL9Q12477 304 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa9.71□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-FP0CX61 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-GR2P0CX62 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ERD2P18414 219 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SNF6P18888 332 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W HOP1P20050 605 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W HCM1P25364 564 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-CP25383 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SCO2P38072 301 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W INM1P38710 295 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W GIC1P38785 314 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPE1P46969 238 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CAF40P53829 373 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-DR2Q03483 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ELP6Q04868 273 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W DXO1Q06349 442 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W IPK1Q06667 281 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PUN1Q06991 263 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YDL176WQ12027 708 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-BQ12260 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SUT2Q12286 268 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-OR2Q12293 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-DR1Q12392 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-OR1Q12439 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TY2A-DR3Q99303 438 aa9.7□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RAS1P01119 309 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W HTS1P07263 546 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CAR2P07991 424 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CKS1P20486 150 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W UTR1P21373 530 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RNA14P25298 677 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PGS1P25578 521 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W IDH2P28241 369 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPF2P36160 344 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CBP4P37267 147 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W OSH7P38755 437 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W LRP1P38801 184 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MSS4P38994 779 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W FMP52P40008 231 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PKP1P40530 394 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W BAP3P41815 604 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PSA1P41940 361 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W QRI7P43122 407 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W BNA6P43619 295 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PRY3P47033 881 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W BFA1P47113 574 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YGR079WP53249 370 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W VOA1P53262 265 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W BIO5P53744 561 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W COS1P53822 381 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TIM44Q01852 431 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W DCI1Q08558 271 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RKM5Q12367 367 aa9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PSF1Q12488 208 aa9.69□□□□□ -0.86
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