RNA–Protein interactions for RNA: YMR064W

AEP1, Transcript of Protein required for expression of the mitochondrial OLI1 gene, yeast

Gene AEP1, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AEP1	YMR064W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AEP1	YMR064W	FSH3	Q99369	266 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AEP1	YMR064W	MAS1	P10507	462 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SWD3	P38123	315 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PRM1	P53835	661 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RIF2	Q06208	395 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	JID1	Q12350	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	IZH2	Q12442	317 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	GRR1	P24814	1151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HMX1	P32339	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YHR131C	P38835	850 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YFR057W	P43625	151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SHE4	P51534	789 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HST1	P53685	503 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	AIM33	Q04516	312 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YPR091C	Q06833	770 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YDL114W	Q07530	308 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PLP2	Q12017	286 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	FCY22	Q12119	530 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HRT3	Q12347	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	VAM7	P32912	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ECM8	P38246	354 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	POP2	P39008	433 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SEC9	P40357	651 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	CLD1	P53264	445 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SHS1	Q07657	551 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	GAT3	Q07928	141 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	GLE1	Q12315	538 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PCL9	Q12477	304 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	STF1	P01098	86 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PRR1	P28708	518 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	MRPL10	P36520	322 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YHR122W	P38829	231 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	BIR1	P47134	954 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	BNS1	P50084	137 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	CRH1	P53301	507 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	CKI1	P20485	582 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	FUN26	P31381	517 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YEL045C	P32616	141 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SPO23	P33757	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	EGT2	P42835	1041 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YHC3	P47040	408 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	MGR3	Q04472	501 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YLH47	Q06493	454 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ARR1	Q06596	294 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	REX3	Q12090	404 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HXT2	P23585	541 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SRB2	P34162	210 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ATG18	P43601	500 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SDT1	P53078	280 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SMP3	Q04174	516 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SPH1	Q06160	661 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	MFG1	Q07684	458 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	FAR1	P21268	830 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	HXT1	P32465	570 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RTC2	P38279	296 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	SDS24	P38314	527 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YHR182W	P38870	785 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	ALP1	P38971	573 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	MIG3	P39943	394 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	CIN2	P46670	268 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YMR027W	Q04371	470 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	RBD2	Q12270	262 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AEP1	YMR064W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	MXR2	P25566	168 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	MRPS5	P33759	307 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	OXA1	P39952	402 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	YMR134W	P40207	237 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	GAB1	P41733	394 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AEP1	YMR064W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98

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