RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SSN2	P38931	1420 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	YOX1	P34161	385 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SNL1	P40548	159 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SHE4	P51534	789 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	MAS1	P10507	462 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	GRR1	P24814	1151 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	VAM7	P32912	316 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	MRPL10	P36520	322 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SEC9	P40357	651 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	BNS1	P50084	137 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	JID1	Q12350	301 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	FSH3	Q99369	266 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	HSL1	P34244	1518 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	FUN26	P31381	517 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SPO23	P33757	523 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	MAM33	P40513	266 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	HAC1	P41546	238 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	BIR1	P47134	954 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	PRM1	P53835	661 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	PLP2	Q12017	286 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	PCL9	Q12477	304 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPC17	YJL011C	RPB5	P20434	215 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MRPL8	P22353	238 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HXT1	P32465	570 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YEL045C	P32616	141 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YHR122W	P38829	231 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YIL089W	P40500	205 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ATG18	P43601	500 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ALF1	P53904	254 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SMP3	Q04174	516 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	FCY22	Q12119	530 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SWR1	Q05471	1514 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MAS2	P11914	482 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	FAR1	P21268	830 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HMX1	P32339	317 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ECM8	P38246	354 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	RTC2	P38279	296 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	POP2	P39008	433 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YFR057W	P43625	151 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CRH1	P53301	507 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
RPC17	YJL011C	ADA2	Q02336	434 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SPH1	Q06160	661 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SHS1	Q07657	551 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	REV1	P12689	985 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CKI1	P20485	582 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HXT2	P23585	541 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MIG3	P39943	394 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SHY1	P53266	389 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YLH47	Q06493	454 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	REX3	Q12090	404 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ATG7	P38862	630 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	OXA1	P39952	402 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HEM14	P40012	539 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	GAB1	P41733	394 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CIN2	P46670	268 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	CLD1	P53264	445 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MHR1	Q06630	226 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SPR1	P32603	445 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MRPS5	P33759	307 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ALP1	P38971	573 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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