RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	HAP4	P14064	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	LDB16	P25587	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YIM1	P28625	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SCW4	YGR279C	ECM15	P35195	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MED8	P38304	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ALP1	P38971	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YTA6	P40328	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SMK1	P41808	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SHR5	P41912	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PEX25	Q02969	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPC19	Q03954	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NAT4	Q04751	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YPS7	Q06325	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SCW4	YGR279C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TOD6	P34219	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YBR139W	P38109	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SLM4	P38247	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	FES1	P38260	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	EXO84	P38261	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YAR028W	P39548	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MBP1	P39678	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YEL068C	P39977	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	IES5	P40060	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	GID8	P40208	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TED1	P40533	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PMT3	P47190	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NCE101	Q02820	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PLM2	Q04383	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RNH1	Q04740	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RNH202	Q05635	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	DCR2	Q05924	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	AKR2	Q12013	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	FRE7	Q12333	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SKS1	Q12505	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	IRA2	P19158	3079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	FLP1	P03870	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	STP22	P25604	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PTR2	P32901	601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GPX1	P36014	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	LHS1	P36016	881 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YHR210C	P38893	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
SCW4	YGR279C	NTA1	P40354	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YIL166C	P40445	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
SCW4	YGR279C	CUP9	P41817	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YGL235W	P53071	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YGL101W	P53144	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PRM8	P53174	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CDH1	P53197	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YGR067C	P53243	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MDM30	Q05930	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SYO1	Q07395	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NFI1	Q12216	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PSF1	Q12488	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HFA1	P32874	2273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TPK3	P05986	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BAR1	P12630	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ITR2	P30606	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SNC1	P31109	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MSN4	P33749	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SPC42	P36094	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TUL1	P36096	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GOS1	P38736	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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