RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MET18	P40469	1032 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	IGD1	P43598	195 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RMI1	Q02685	241 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SCS7	Q03529	384 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	STH1	P32597	1359 aa		0.28	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IMA3	P0CW40	589 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IMA4	P0CW41	589 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CAP2	P13517	287 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CBS1	P14066	229 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ANP1	P32629	500 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	UTR5	P32630	166 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SHE1	P38200	338 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YHR054C	P38780	354 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YFR057W	P43625	151 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	GIP3	Q03016	1276 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	VTI1	Q04338	217 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SOR2	Q07786	357 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IMA2	Q08295	589 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ATG34	Q12292	412 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SKM1	Q12469	655 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RAD14	P28519	371 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CMC1	P36064	111 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SEC9	P40357	651 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	AIM24	P47127	394 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	HMS2	P47175	358 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TOM22	P49334	152 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SFM1	Q12314	213 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	HIF1	Q12373	385 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	NCA2	Q12374	616 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	AFG1	P32317	509 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PMT1	P33775	817 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PFS1	P38872	237 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YER084W	P40057	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RMD8	P43620	662 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DSL1	P53847	754 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YDL199C	Q12407	687 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	KRE5	P22023	1365 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	COX10	P21592	462 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FUI1	P38196	639 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MMS4	P38257	691 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CIN2	P46670	268 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	OAZ1	Q02803	292 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	INP2	Q03824	705 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YDR222W	Q04925	415 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ASA1	Q06822	443 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PLB3	Q08108	686 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SMC5	Q08204	1093 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	TOM1	Q03280	3268 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YLL067C	Q07888	1374 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	AAC3	P18238	307 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CMK2	P22517	447 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	GIT1	P25346	518 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	RPB9	P27999	122 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	MCM10	P32354	571 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	AST1	P35183	429 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	GPX2	P38143	162 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YBL029W	P38201	376 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	COX14	P39103	70 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YER184C	P39961	794 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	VHS2	P40463	436 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FMS1	P50264	508 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CLD1	P53264	445 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	BET5	Q03630	159 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	CCE1	Q03702	353 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	IOC4	Q04213	475 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FAR10	Q06001	478 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YPL278C	Q08990	100 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ATG29	Q12092	213 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FCY22	Q12119	530 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	FRE8	Q12209	686 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	ENT1	Q12518	454 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	SAG1	P20840	650 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	DAL81	P21657	970 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	PTH2	P34222	208 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CSE1	YGL238W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37

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