RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W IMG1P25626 169 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YHR131CP38835 850 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YHR218WP38899 603 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RBG1P39729 369 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YJL068CP40363 299 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CIN1P40987 1014 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W QRI1P43123 477 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PTR3P43606 678 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YJR154WP47181 346 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TWF1P53250 332 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W COG5P53951 403 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W KTR6P54070 446 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SWP1Q02795 286 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GAS3Q03655 524 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RCF1Q03713 159 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W FIN1Q03898 291 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YDR131CQ03899 556 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PEX12Q04370 399 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GAL83Q04739 417 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BSP1Q06604 576 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data5.21□□□□□ -1.58not detected
VHS1YDR247W YOL019WQ08157 551 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MED2Q12124 431 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RLM1Q12224 676 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W UBX3Q12229 455 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ISA2Q12425 185 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SAS5Q99314 248 aa5.21□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W THP2O13539 261 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W APE1P14904 514 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BEM1P29366 551 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W APE2P32454 952 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MEI5P32489 222 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W WBP1P33767 430 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W FRE2P36033 711 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CMC1P36064 111 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ECM8P38246 354 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ICS2P38284 255 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YEL028WP39989 153 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SSU1P41930 458 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W EFM3P47163 339 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W KEL2P50090 882 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GTR2P53290 341 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ALG11P53954 548 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SPR6Q01684 191 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PDR8Q06149 701 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GPI11Q06636 219 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YLR413WQ06689 675 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W THP3Q12049 470 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TY3A-GQ12173 290 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BBP1Q12365 385 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CTF3Q12748 733 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TY3A-IQ99219 290 aa5.2□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W NFT1P0CE68 1218 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W NSP1P14907 823 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GLN3P18494 730 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YCR006CP25350 157 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BOS1P25385 244 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CIN8P27895 1000 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W SYN8P31377 255 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PTM1P32857 523 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MRP21P38175 177 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PRM9P39551 298 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W JLP2P40206 208 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W BIR1P47134 954 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W CLD1P53264 445 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TOF2Q02208 771 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ARP10Q04549 284 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W APC4Q04601 652 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TPO3Q06451 622 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W TEN1Q07921 160 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W MCH4Q08268 501 aa5.19□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ADE4P04046 510 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W HEM2P05373 342 aa5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W GPH1P06738 902 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W COS2P0CX12 379 aa5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W COS3P0CX13 379 aa5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W YAP1P19880 650 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W APN1P22936 367 aa5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W ADK2P26364 225 aa5.18□□□□□ -1.58
VHS1YDR247W PPZ1P26570 692 aa5.18□□□□□ -1.58
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