RNA–Protein interactions for RNA: YDR167W

TAF10, Transcript of Subunit (145 kDa) of TFIID and SAGA complexes, yeast

Gene TAF10, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF10	YDR167W	MPS2	P53159	387 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	AIM6	Q07716	390 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RRT8	Q08219	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ICT1	Q12385	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ISN1	Q99312	450 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YIM1	P28625	365 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	HIS2	P38635	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	FAD1	P38913	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	VRG4	P40107	337 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	PKP1	P40530	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MET28	P40573	187 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	AAD10	P47182	288 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	PET117	Q02771	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MGR3	Q04472	501 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	POM34	Q12445	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MAL32	P38158	584 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MRP21	P38175	177 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YBR062C	P38239	180 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SPC97	P38863	823 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ICE2	P40499	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	CYK3	Q07533	885 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YEH1	Q07804	573 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	LDB17	Q12342	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YPT6	Q99260	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
TAF10	YDR167W	YCR099C	P25657	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YMC1	P32331	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	APT2	P36973	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RRT2	P38332	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	GET2	P40056	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SLZ1	P40167	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	PET130	P47065	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	BIO3	P50277	480 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YGR066C	P53242	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ECM18	Q04623	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	VPS38	Q05919	439 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ARR3	Q06598	404 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MDM36	Q06820	579 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SLD7	Q08457	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RSA1	Q08932	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MLH3	Q12083	715 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	ATG29	Q12092	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	UBX3	Q12229	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	RGT2	Q12300	763 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	SPE4	Q12455	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TAF10	YDR167W	BPH1	P25356	2167 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	MAK32	P23060	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	DOA4	P32571	926 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	RRN10	P38204	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	INM1	P38710	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	GGC1	P38988	300 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	MET30	P39014	640 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	VPS52	P39904	641 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	SEC9	P40357	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	RAD17	P48581	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TAF10	YDR167W	YGR015C	P53208	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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