RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	SPO73	P40031	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	EMP65	P40085	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	COG3	P40094	801 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RET2	P43621	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PMT3	P47190	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SPT20	P50875	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FLC3	P53121	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SCW11	P53189	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SHY1	P53266	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MKC7	P53379	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	EAF1	Q06337	982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARV1	Q06541	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YRM1	Q12340	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ERP4	Q12450	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FLP1	P03870	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PHO80	P20052	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	COQ2	P32378	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TIP20	P33891	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PXA2	P34230	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	APT2	P36973	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	COS8	P38723	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MED6	P38782	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PCL5	P38794	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PIC2	P40035	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	VRG4	P40107	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MEP1	P40260	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AYR1	P40471	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FKH2	P41813	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YFL066C	P43538	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PTR3	P43606	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RMD8	P43620	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	JAC1	P53193	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TIM44	Q01852	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TDA1	Q03533	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CIA1	Q05583	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TGL5	Q12043	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	JLP1	Q12358	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MTR10	Q99189	972 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GAL1	P04385	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CDC21	P06785	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	VMA3	P25515	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ECM25	P32525	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DBP8	P38719	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HSE1	P38753	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	OSH7	P38755	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GIC1	P38785	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AIM2	P39721	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ERV46	P39727	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GID8	P40208	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GDS1	P41913	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BIT61	P47041	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GTO1	P48239	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PRM8	P53174	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YHM2	Q04013	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	THI73	Q07904	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SFG1	Q12507	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARG81	P05085	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MSF1	P08425	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CWH43	P25618	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NAM9	P27929	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ACP1	P32463	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SRB6	P32570	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SDH3	P33421	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GEP4	P38812	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NSG1	P38837	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NVJ1	P38881	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SSN3	P39073	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RGA1	P39083	1007 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YIL077C	P40508	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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