RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 F2P00734 622 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GNAT1P11488 350 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 THPOP40225 353 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SP2Q02086 613 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GUCY1B3Q02153 619 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 NR5A1Q13285 461 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PTK7Q13308 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PKP1Q13835 747 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 NEDD9Q14511 834 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 NLRX1Q86UT6 975 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SESTD1Q86VW0 696 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ASB2Q96Q27 587 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ESYT2A0FGR8 921 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SMCO2A6NFE2 343 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 HAS3O00219 553 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TNFRSF10AO00220 468 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 FIBPO43427 364 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 NBNO60934 754 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 EFCAB14O75071 495 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 STAM2O75886 525 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DEXIO95424 95 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 AMHP03971 560 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 LGALS2P05162 132 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CTSHP09668 335 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 RSPH10BP0C881 870 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 RPIAP49247 311 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 NAPAP54920 295 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DEFB103AP81534 67 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TAP1Q03518 808 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 AAK1Q2M2I8 961 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 KRT40Q6A162 431 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 LENG9Q96B70 501 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 VWCEQ96DN2 955 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 EMSYQ7Z589 1322 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TET1Q8NFU7 2136 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 COL6A3P12111 3177 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TREHO43280 583 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 LGR5O75473 907 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 UPP2O95045 317 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ITGB5P18084 799 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GJB2P29033 226 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DDIT3P35638 169 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SLC19A1P41440 591 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ADCY7P51828 1080 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGAP4P98171 946 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 METTL7BQ6UX53 244 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM50Q86XT4 487 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 SEPT8Q92599 483 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GLG1Q92896 1179 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 WNT8BQ93098 351 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 GJA10Q969M2 543 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-215ENST00000622972 UIMC1Q96RL1 719 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms