RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 MSL1Q68DK7 614 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.015e-7■■□□□ 13.4
HPS1-215ENST00000613394 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SEMA3FQ13275 785 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 FMO2Q99518 471 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CCDC172P0C7W6 258 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 EPN3Q9H201 632 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TAF1P21675 1872 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ESYT2A0FGR8 921 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ZBTB39O15060 712 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 NOL4O94818 638 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CPXCR1Q8N123 301 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PPM1KQ8N3J5 372 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 NUP188Q5SRE5 1749 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 EVI5O60447 810 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PON1P27169 355 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SNX1Q13596 522 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MTMR3Q13615 1198 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CCDC38Q502W7 563 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 NSMFQ6X4W1 530 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RPS6KA5O75582 802 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 FERP16591 822 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RHBDL3P58872 404 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PTGISQ16647 500 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 VEZTQ9HBM0 779 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GGT7Q9UJ14 662 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 DR1Q01658 176 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 NUP98P52948 1817 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 F5H6K3 240 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 USP11P51784 963 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 KLRC3Q07444 240 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 DYDC2Q96IM9 177 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 RAB17Q9H0T7 212 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GMNCA6NCL1 334 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CCDC169A6NNP5 214 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 K7ENM7 598 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PJA2O43164 708 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 KRT5P13647 590 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MYL7Q01449 175 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CUL1Q13616 776 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MCTP2Q6DN12 878 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 GH2P01242 217 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TM4SF1P30408 202 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CALCOCO2Q13137 446 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 COG2Q14746 738 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 CAVIN3Q969G5 261 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 PNMA2Q9UL42 364 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-215ENST00000613394 BBOX1O75936 387 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms