RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SDF4Q9BRK5 362 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 TMX1Q9H3N1 280 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 JADE2Q9NQC1 790 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 DMDP11532 3685 aa16.23■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PROB1E7EW31 1015 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 DDAH1O94760 285 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 LAG3P18627 525 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 GNAQP50148 359 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ERVFC1P60507 584 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PTH1RQ03431 593 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 MTMR3Q13615 1198 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PLCB4Q15147 1175 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 RGS18Q9NS28 235 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 GINS2Q9Y248 185 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 LZTS1Q9Y250 596 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 E7EWF7 191 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 FSCN2O14926 492 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR182O15218 404 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC26A2P50443 739 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 STAT5BP51692 787 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ANTXR2P58335 489 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 PCYT2Q99447 389 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAM2Q99965 735 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 TCF25Q9BQ70 676 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 S1PR5Q9H228 398 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-202ENST00000525711 NFASCO94856 1347 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 ACTR2P61160 394 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PLCB3Q01970 1234 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNC3Q14003 757 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2SQ16763 222 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 CES5AQ6NT32 575 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 CASP10Q92851 521 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.2■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 COL1A2P08123 1366 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 HOXA2O43364 376 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 MGEA5O60502 916 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 REC8O95072 547 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PPM1AP35813 382 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KRT17Q04695 432 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 MYL10Q9BUA6 226 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 APOL5Q9BWW9 433 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR23AA6NEV1 266 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 C9IYK1 514 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 HBP1O60381 514 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KLRC1P26715 233 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 APOBRQ0VD83 1088 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 NECTIN1Q15223 517 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 ABI1Q8IZP0 508 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 MTA3Q9BTC8 594 aa16.18■□□□□ 0.18
UBASH3B-202ENST00000525711 CWH43Q9H720 699 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms