RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 RSPH3Q86UC2 560 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CASP10Q92851 521 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 NECTIN4Q96NY8 510 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CASD1Q96PB1 797 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ADAM2Q99965 735 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SEMA4AQ9H3S1 761 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KCNK12Q9HB15 430 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 LZTS1Q9Y250 596 aa12.01□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 LRRN2O75325 713 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CFHP08603 1231 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 POLR2MP0CAP2 368 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 MTHFRP42898 656 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TDGQ13569 410 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ASPRV1Q53RT3 343 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SPECC1Q5M775 1068 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KIAA1841Q6NSI8 718 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TMC5Q6UXY8 1006 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 MFSD6Q6ZSS7 791 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TMC7Q7Z402 723 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 MIER1Q8N108 512 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CYP26B1Q9NR63 512 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 RGS18Q9NS28 235 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 DUSP12Q9UNI6 340 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB5O15062 677 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FIBPO43427 364 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CYTH3O43739 400 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KCNA2P16389 499 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TGM1P22735 817 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FAM189BP81408 668 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 IER5Q5VY09 327 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 GPATCH3Q96I76 525 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PIGSQ96S52 555 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 USTQ9Y2C2 406 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SQORQ9Y6N5 450 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ZZEF1O43149 2961 aa11.99□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SPEGQ15772 3267 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FSD2A1L4K1 749 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PLCB4Q15147 1175 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 HOMER1Q86YM7 354 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KAT14Q9H8E8 782 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CA14Q9ULX7 337 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 GINS2Q9Y248 185 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.98□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 B4E1Z4 1266 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KLRF2D3W0D1 207 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 STK25O00506 426 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 CXCL14O95715 111 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ITGB5P18084 799 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 LAG3P18627 525 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 KRT76Q01546 638 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 DSC3Q14574 896 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 GNPTABQ3T906 1256 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 GLG1Q92896 1179 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 SENP2Q9HC62 589 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.96□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CCNC-211ENST00000521017 ADRB1P08588 477 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms