RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 C20orf173Q96LM9 149 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 MYOTQ9UBF9 498 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
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ANKRD28-211ENST00000492895 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SOD2P04179 222 aa4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 GRK2P25098 689 aa4.47□□□□□ -1.69
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ANKRD28-211ENST00000492895 EVA1CP58658 441 aa4.47□□□□□ -1.69
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ANKRD28-211ENST00000492895 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.47□□□□□ -1.69
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ANKRD28-211ENST00000492895 TECPR2O15040 1411 aa4.46□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 TNS3Q68CZ2 1445 aa4.46□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.46□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF10O15013 1369 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 AQP7O14520 342 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC27A2O14975 620 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 COL6A2P12110 1019 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 THBS2P35442 1172 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 EXOC2Q96KP1 924 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ALG1Q9BT22 464 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SHPRHQ149N8 1683 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SBNO1A3KN83 1393 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 LRG1P02750 347 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GNAT1P11488 350 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 PAK1Q13153 545 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NFIXQ14938 502 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 LILRB2Q8N423 598 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 RELTQ969Z4 430 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA0232Q92628 1395 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NOBOXO60393 691 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GABREP78334 506 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GUCY1A3Q02108 690 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIN1Q05586 938 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAM9Q13443 819 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TUSC3Q13454 348 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 C2orf27AQ580R0 203 aa4.44□□□□□ -1.7
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