RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FLT1P17948 1338 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PDHXO00330 501 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CXCL11O14625 94 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TMPRSS2O15393 492 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TREHO43280 583 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PLCL1Q15111 1095 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PANK1Q8TE04 598 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 BORCS6Q96GS4 357 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM210AQ96ND0 272 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PIDD1Q9HB75 910 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CPA4Q9UI42 421 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 LTBP2Q14767 1821 aa7.11□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SZT2Q5T011 3432 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CFAP69A5D8W1 941 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GPR182O15218 404 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CYP2C8P10632 490 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PEX19P40855 299 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CDK5R2Q13319 367 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PICALMQ13492 652 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TREML2Q5T2D2 321 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GPATCH3Q96I76 525 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP7D2Q96T17 732 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.1□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 LCTP09848 1927 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 C8AP07357 584 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SLFN14P0C7P3 912 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM87AP0C7U9 286 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CAP2P40123 477 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TDO2P48775 406 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SPRED2Q7Z698 418 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MISP3Q96FF7 219 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CITED4Q96RK1 184 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SRRDQ9UH36 339 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GABRQQ9UN88 632 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.09□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 PAPLNO95428 1278 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 ID3Q02535 119 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 PRKCZQ05513 592 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 FAAP100Q0VG06 881 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 RPAINQ86UA6 219 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 RNF19AQ9NV58 838 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 SWAP70Q9UH65 585 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.08□□□□□ -1.28
JMJD1C-208ENST00000490669 LAMA4Q16363 1823 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms